MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1 chromosome

Total Repeats: 74307

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_008340	GCC	2	6	198770	198775	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319329
4502	NC_008340	AGGCGA	2	12	198790	198801	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	114319329
4503	NC_008340	GCC	2	6	198861	198866	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319329
4504	NC_008340	CCG	2	6	198882	198887	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319329
4505	NC_008340	GCC	2	6	198903	198908	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319329
4506	NC_008340	CCG	2	6	198928	198933	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319329
4507	NC_008340	CGG	2	6	198934	198939	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319329
4508	NC_008340	GCC	2	6	198941	198946	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319329
4509	NC_008340	GGA	2	6	198947	198952	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114319329
4510	NC_008340	GCC	2	6	198953	198958	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319329
4511	NC_008340	TTC	2	6	198984	198989	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114319329
4512	NC_008340	GTA	2	6	198998	199003	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114319329
4513	NC_008340	GGA	2	6	199016	199021	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114319329
4514	NC_008340	CAC	2	6	199088	199093	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114319329
4515	NC_008340	CGT	2	6	199099	199104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319329
4516	NC_008340	AGA	2	6	199165	199170	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114319329
4517	NC_008340	CGG	2	6	199216	199221	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319329
4518	NC_008340	CGG	3	9	199243	199251	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319329
4519	NC_008340	TGA	2	6	199276	199281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114319329
4520	NC_008340	GC	3	6	199313	199318	0 %	0 %	50 %	50 %	114319329
4521	NC_008340	CGCA	2	8	199358	199365	25 %	0 %	25 %	50 %	114319329
4522	NC_008340	GCG	3	9	199368	199376	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319329
4523	NC_008340	CATG	2	8	199396	199403	25 %	25 %	25 %	25 %	114319329
4524	NC_008340	CGA	2	6	199621	199626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319330
4525	NC_008340	TTC	2	6	199721	199726	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114319330
4526	NC_008340	ACG	2	6	199878	199883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319331
4527	NC_008340	TCG	2	6	200001	200006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319331
4528	NC_008340	GCG	2	6	200013	200018	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319331
4529	NC_008340	AGGCCA	2	12	200019	200030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319331
4530	NC_008340	TGC	2	6	200115	200120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319331
4531	NC_008340	TCA	2	6	200127	200132	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114319331
4532	NC_008340	AGCCC	2	10	200160	200169	20 %	0 %	20 %	60 %	114319331
4533	NC_008340	TG	3	6	200183	200188	0 %	50 %	50 %	0 %	114319331
4534	NC_008340	GCG	2	6	200193	200198	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319331
4535	NC_008340	CCG	2	6	200232	200237	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319331
4536	NC_008340	GGGCGC	2	12	200239	200250	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319331
4537	NC_008340	TGG	2	6	200265	200270	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319331
4538	NC_008340	GGC	3	9	200281	200289	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319331
4539	NC_008340	TGG	3	9	200331	200339	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319331
4540	NC_008340	GGC	2	6	200348	200353	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319331
4541	NC_008340	CGG	2	6	200413	200418	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319331
4542	NC_008340	CGA	2	6	200428	200433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319331
4543	NC_008340	CAT	2	6	200437	200442	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114319331
4544	NC_008340	ACC	2	6	200483	200488	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114319331
4545	NC_008340	GCGGA	2	10	200489	200498	20 %	0 %	60 %	20 %	114319331
4546	NC_008340	GAGGTG	2	12	200543	200554	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	114319331
4547	NC_008340	GCT	2	6	200740	200745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319331
4548	NC_008340	GCT	2	6	200761	200766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319331
4549	NC_008340	GGA	2	6	200770	200775	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114319331
4550	NC_008340	GGT	3	9	200788	200796	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319331
4551	NC_008340	CGA	2	6	200800	200805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319331
4552	NC_008340	G	6	6	200831	200836	0 %	0 %	100 %	0 %	114319331
4553	NC_008340	GAT	2	6	200848	200853	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114319331
4554	NC_008340	TCA	2	6	200877	200882	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114319331
4555	NC_008340	TGC	2	6	201045	201050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319332
4556	NC_008340	TGA	2	6	201072	201077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114319332
4557	NC_008340	GGT	2	6	201130	201135	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319332
4558	NC_008340	GCA	2	6	201145	201150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319332
4559	NC_008340	GCCA	2	8	201173	201180	25 %	0 %	25 %	50 %	114319332
4560	NC_008340	CAG	2	6	201209	201214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319332
4561	NC_008340	TGG	2	6	201216	201221	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319332
4562	NC_008340	TGGAGA	2	12	201288	201299	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	114319332
4563	NC_008340	CTC	2	6	201325	201330	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114319332
4564	NC_008340	CCA	2	6	201424	201429	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114319332
4565	NC_008340	CTG	2	6	201653	201658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319332
4566	NC_008340	G	6	6	201673	201678	0 %	0 %	100 %	0 %	114319332
4567	NC_008340	CG	3	6	201687	201692	0 %	0 %	50 %	50 %	114319332
4568	NC_008340	GTG	2	6	201719	201724	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319332
4569	NC_008340	GCCC	2	8	201758	201765	0 %	0 %	25 %	75 %	114319332
4570	NC_008340	GGC	2	6	201769	201774	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319332
4571	NC_008340	G	6	6	201808	201813	0 %	0 %	100 %	0 %	114319332
4572	NC_008340	CGG	2	6	201840	201845	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319332
4573	NC_008340	GCCCCA	2	12	201881	201892	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	114319332
4574	NC_008340	GGA	2	6	201907	201912	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114319332
4575	NC_008340	CGC	2	6	201922	201927	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319332
4576	NC_008340	GCCG	2	8	201934	201941	0 %	0 %	50 %	50 %	114319332
4577	NC_008340	GAG	2	6	201953	201958	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114319332
4578	NC_008340	CTGG	2	8	202140	202147	0 %	25 %	50 %	25 %	114319333
4579	NC_008340	CTG	2	6	202180	202185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319333
4580	NC_008340	ATC	2	6	202222	202227	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114319333
4581	NC_008340	CGG	2	6	202240	202245	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319333
4582	NC_008340	CTG	3	9	202285	202293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319333
4583	NC_008340	TGCAG	2	10	202299	202308	20 %	20 %	40 %	20 %	114319333
4584	NC_008340	CGGC	2	8	202338	202345	0 %	0 %	50 %	50 %	114319333
4585	NC_008340	C	6	6	202351	202356	0 %	0 %	0 %	100 %	114319333
4586	NC_008340	CTGG	2	8	202365	202372	0 %	25 %	50 %	25 %	114319333
4587	NC_008340	GGCGC	2	10	202384	202393	0 %	0 %	60 %	40 %	114319333
4588	NC_008340	CTG	2	6	202414	202419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319333
4589	NC_008340	CG	3	6	202425	202430	0 %	0 %	50 %	50 %	114319333
4590	NC_008340	AGT	2	6	202448	202453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114319333
4591	NC_008340	CAC	2	6	202464	202469	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114319334
4592	NC_008340	TTC	2	6	202509	202514	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114319334
4593	NC_008340	CGC	2	6	202515	202520	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319334
4594	NC_008340	GTG	2	6	202524	202529	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319334
4595	NC_008340	GCG	2	6	202530	202535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319334
4596	NC_008340	GTCT	2	8	202542	202549	0 %	50 %	25 %	25 %	114319334
4597	NC_008340	CAG	2	6	202623	202628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319334
4598	NC_008340	GCC	2	6	202652	202657	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319334
4599	NC_008340	CCT	2	6	202711	202716	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114319334
4600	NC_008340	GCT	2	6	202760	202765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319334
4601	NC_008340	GGC	2	6	202766	202771	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319334
4602	NC_008340	GGT	2	6	202781	202786	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319334
4603	NC_008340	CAG	3	9	202818	202826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319334
4604	NC_008340	GC	3	6	202832	202837	0 %	0 %	50 %	50 %	114319334
4605	NC_008340	GAG	3	9	202878	202886	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114319334
4606	NC_008340	CACCGT	2	12	202905	202916	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	114319334
4607	NC_008340	CCG	2	6	203021	203026	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319334
4608	NC_008340	GCA	2	6	203050	203055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319334
4609	NC_008340	CTG	2	6	203097	203102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319334
4610	NC_008340	CGGG	2	8	203105	203112	0 %	0 %	75 %	25 %	114319334
4611	NC_008340	TGC	2	6	203152	203157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319334
4612	NC_008340	CCG	2	6	203175	203180	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319334
4613	NC_008340	GGC	2	6	203237	203242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319334
4614	NC_008340	GGT	2	6	203264	203269	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319334
4615	NC_008340	GGC	2	6	203343	203348	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319334
4616	NC_008340	CAG	2	6	203358	203363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319334
4617	NC_008340	CAGC	2	8	203387	203394	25 %	0 %	25 %	50 %	114319334
4618	NC_008340	CCG	2	6	203427	203432	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319334
4619	NC_008340	CCA	2	6	203437	203442	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114319334
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4621	NC_008340	CCG	2	6	203495	203500	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319334
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4743	NC_008340	CCG	2	6	208266	208271	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319338
4744	NC_008340	GTG	2	6	208298	208303	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319338
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4746	NC_008340	GCT	2	6	208348	208353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319338
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4843	NC_008340	GA	4	8	212642	212649	50 %	0 %	50 %	0 %	114319344
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4852	NC_008340	GAT	2	6	212852	212857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114319344
4853	NC_008340	CCGCC	2	10	213034	213043	0 %	0 %	20 %	80 %	114319345
4854	NC_008340	ACC	2	6	213081	213086	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114319345
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4857	NC_008340	GA	3	6	213249	213254	50 %	0 %	50 %	0 %	114319345
4858	NC_008340	CGC	2	6	213277	213282	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319346
4859	NC_008340	ACC	2	6	213307	213312	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114319346
4860	NC_008340	CGA	2	6	213381	213386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319346
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4862	NC_008340	GGT	2	6	213408	213413	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319346
4863	NC_008340	TCA	2	6	213467	213472	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114319346
4864	NC_008340	CAT	3	9	213588	213596	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114319346
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4866	NC_008340	ATTG	2	8	213684	213691	25 %	50 %	25 %	0 %	114319346
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4935	NC_008340	GTC	2	6	217449	217454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319349
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4974	NC_008340	TGGA	2	8	218911	218918	25 %	25 %	50 %	0 %	114319350
4975	NC_008340	CCAC	2	8	218981	218988	25 %	0 %	0 %	75 %	114319350
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4979	NC_008340	ACC	3	9	219119	219127	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114319350
4980	NC_008340	ATC	2	6	219142	219147	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114319350
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4984	NC_008340	CCG	3	9	219484	219492	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319351
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4987	NC_008340	GAG	2	6	219594	219599	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114319351
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4991	NC_008340	CCG	2	6	219857	219862	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319351
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